В заповеднике установлен факт браконьерства. В ходе рейда 19.01.2013 г. в 313 кв., южнее КПП-5 (въезд в ЗАТО г. Саров) недалеко от автомобильной дороги Жегалово - Саров были обнаружены остатки убитой лосихи. Установлено, что преступление совершено в ночь с 18 на 19.01.2013 г. Животное было беременно, обнаружено 2 зародыша. По факту браконьерства возбуждено уголовное дело.

В заповеднике в конце января были проведены зимние марштрутные учеты (ЗМУ) на традиционных учетных площадках. Результаты учетов обрабатываются и будут представлены в Летописи природы.

В субботу, 15 декабря 2012 г. проходило заседание научно-технического совета Мордовского государственного природного заповедника имени П.Г. Смидовича (присутствовали 14 членов совета). Во время заседания были заслушаны и обсуждены отчеты о проделанной в 2012 г. работе начальников отделов охраны заповедной территории, экологического просвещения и туризма, административно-хозяйственной работы, научного отдела, главного бухгалтера. Также были рассмотрены отчеты о работе за 2012 г. и планы НИР на 2013 г. сотрудников научного отдела. Кроме того, обсуждались вопросы об изменении границ обходов в Пуштинском лесничестве, возможности восстановления зубропитомника в МГПЗ, издании монографий и подготовке к печати учебного пособия "Методы полевых экологических исследований", создании цифровых баз данных (ГИС) и коллекций по флоре и фауне МГПЗ, ряд вопросов по охране территории заповедника. тоге, единогласно были приняты следующие решения: 1. Принять отчеты сотрудников заповедника о проделанной работе за 2012 г. 2. Утвердить планы работы на 2013 г. 3. Изменить границы обходов Пуштинского лесничества с целью оптимизации их охраны. 4. Организовать дежурство на КПП п. Пушта для предотвращения несанкционированного нахождения лиц в заповеднике. 5. Подготовиь к печати в 2013 г. учебное пособие "Методы полевых экологических исследований". 6. Начать заполнение цифровых баз данных (ГИС) по флоре и фауне МГПЗ.

Научные сотрудники заповедника приняли участие в конференции «Малые реки: экологическое состояние и перспективы развития», проходившей в г. Чебоксары 8 декабря 2012 г. 

Мордовский заповедник совместно с Темниковской районной станцией по борьбе с болезнями животных провел мероприятия по профилактике бешенства на своей и прилегающей к заповеднику территориях. Была раскидана вакцина «Рабивак- 0/333» по южной границы заповедника от кордона Дрожденовский до кордона Новенький.  Данные мероприятия проведены с целью уменьшения риска заражения диких животных вирусом бешенства."