Контроль за обеспечением работы экспертного совета возложен на заместителя Министра природных ресурсов и экологии РФ Рината Гизатулина. Экспертный совет создан в соответствии с Концепцией развития системы ООПТ федерального значения на период до 2020 г., утвержденной распоряжением Правительства РФ в целях совершенствования государственного управления в области организации и функционирования ООПТ.