В заповеднике установлен факт браконьерства. В ходе рейда 19.01.2013 г. в 313 кв., южнее КПП-5 (въезд в ЗАТО г. Саров) недалеко от автомобильной дороги Жегалово - Саров были обнаружены остатки убитой лосихи. Установлено, что преступление совершено в ночь с 18 на 19.01.2013 г. Животное было беременно, обнаружено 2 зародыша. По факту браконьерства возбуждено уголовное дело.