Научные сотрудники заповедника приняли участие в конференции «Малые реки: экологическое состояние и перспективы развития», проходившей 8 декабря 2012 г. в г. Чебоксары. Конференция проходила в Национальной библиотеке Чувашской Республики. В работе конференции приняли участие 42 человека из разных регионов России. 
Было заслушано 16 докладов по разным аспектам изучения малых рек. Заседание конференции проходило в двух секциях: посвященные гидрологическим аспектам, а также биоразнообразию и структурно-функциональной организации экосистем малых рек. К началу конференции был выпущен сборник ее трудов. По итогам конференции были выделены рекомендации по сохранению и улучшению состояния малых рек как областей сосредоточения биоразнообразия. Было предложено сосредоточить усилия на сохранении и дальнейшем комплексном изучении малых рек России.